Le Livre des neuf rochers comporte cinq parties : un Prologue, une introduction aux circonstances de la vision des neuf rochers (1ère partie), une présentation du paysage montré dans cette vision (2° partie), une présentation des différentes catégories de la société (3° partie), une description des neuf rochers comme degrés vers sur la voie qui mène vers l'Origine (4° partie), enfin une vision de l'Origine qui est le retour à Dieu (5° partie).